泛素-蛋白酶体系统(UPS)职能错乱与多种疾病的产生拥有亲昵关系,蕴含肿瘤、心血管疾病、神经退行性疾病等。因而,UPS已经成为有关疾病医治的热点靶点之一。抑造泛素-蛋白酶体系统,调控有关底物蛋白的降解,实现疾病医治是沉要的药物开发战术,目前靶向泛素-蛋白酶体系统的幼分子抑造剂钻研重要有泛素活化酶E1抑造剂、泛素结合酶E2抑造剂、泛素衔接酶E3抑造剂以及蛋白酶体抑造剂等。
TAK-243是一种初创的(First-in-Class)、高效的泛素活化酶E1 (UAE) 抑造剂。钻研发现TAK-243拥有显著的抗肿瘤活性。其中,科研人员通过JDB电子使用HCC-70模型进行体内药效尝试。了局发现肿瘤成长抑造率(TGI)达到91%。本篇文章结合文件报路和JDB电子药效部门的经验,分享泛素化抑造剂研发的药效钻研案例,但愿对关注泛素化钻研和肿瘤药效的各位科研工作者有所援手。
泛素化
泛素分子在一系列特殊的酶作用下,将细胞内的蛋白质分化,从当选出靶蛋白分子,并对靶蛋白进行特异性建饰的过程。泛素化在蛋白质的定位、代谢、职能调节和降解中都起着极度沉要的作用,也参加了细胞周期、细胞增殖、细胞凋亡、细胞分化、转移、基因表白、转录调节、信号传导、危险建复、免疫炎症等多多性命活动的调控。
泛素-蛋白酶体系统
泛素-蛋白酶体系统 (Ubiquitin-Proteasome System,UPS) 是细胞内掌管蛋白质降解的多组分系统,介导真核生物80%以上的蛋白质降解,参加细胞的成长及分化、DNA复造与建复、细胞代谢、免疫反映等。泛素-蛋白酶体系统(ubiquitin-proteasome system,UPS)重要由泛素(ubiquitin,Ub)、泛素活化酶E1、泛素结合酶E2、泛素衔接酶E3、去泛素化酶(deubiquitylating enzymes,DUBs)和26S蛋白酶体组成。

泛素-蛋白酶体系统(UPS)[1]
泛素(ubiquitin,Ub)
泛素是一种宽泛散布在真核细胞中的高度守旧的幼分子蛋白。单个泛素分子由76个氨基酸残基组成。重要职能是象征必要分化掉的靶蛋白,使其被26S蛋白酶体降解。泛素还能够象征跨膜蛋白,参加蛋白质的跨膜运输。

泛素结构图(起源:Wikipedia)
泛素活化酶(E1)
泛素活化酶,也称为E1酶,是泛素与底物蛋白结合所必要的第一个酶,在结构上含有地位固定的守旧的半胱氨酸残基,通过半胱氨酸残基与泛素的C端形成高能硫酯键而激活泛素。对于调节泛素稳态和下游泛素化依赖性细胞过程(蕴含通过泛素-蛋白酶体系统的蛋白水解和选择性自噬)拥有沉要作用。
泛素结合酶(E2)
在泛素化过程中,泛素结合酶E2阐扬极度沉要的作用,是其中必不成少的中央环节。泛素结合酶E2是由很多蛋白质所组成的超家族,结构和职能方面都存在多样性。所有的泛素结合酶都含有一个守旧结构域——UBC结构域。泛素结合酶 (E2) 将泛素从泛素活化酶 (E1) 转运到泛素衔接酶 (E3) 和底物中起关键作用。
泛素衔接酶(E3)
泛素化级联反映中的第三个酶,催化将结合在泛素结合酶上的泛素传递给指标蛋白质,泛素衔接酶E3决定靶蛋白的特异性鉴别,在泛素化蹊径中拥有沉要作用。泛素衔接酶E3通过调控调节蛋白的泛素化过程参加细胞内的多种生理过程。所有的E3都拥有衔接靶蛋白和特定E2的能力。泛素衔接酶E3结构域重要蕴含HECT结构域、RING结构域和U-box结构域。正是由于这些复杂多变的E3家族成员能够对分歧底物进行特异性鉴别,泛素化蹊径才出现出蛋白降解的高度选择性。
去泛素化酶(DUBs)
去泛素化酶家族掌管通过水解泛素羧基结尾的酯键、肽键或异肽键,将泛素分子特异性的从链接有泛素的蛋白质或者前体蛋白水解下来,起到去泛素化的作用,对蛋白降解进行反向调节,从而影响蛋白质的职能。
蛋白酶体 (Proteasome)
26S蛋白酶体是降解泛素化底物的ATP依赖型蛋白水解复合体,由20S主题颗粒、19S调节颗粒和11S调节因子组成。26S蛋白酶体是泛素介导的蛋白质降解的中心蛋白酶。通过节造参加细胞凋亡、细胞周期和信号转导的关键蛋白的降解,在细胞稳态中阐扬沉要作用。 蛋白酶体拥有多种职能,是药物开发的沉要靶标,出格是在肿瘤和神经退行性疾病中。在从前的二十年中已经鉴定了很多选择性蛋白酶体抑造剂并核准用于临床(如:Bortezomib,Carfilzomib等)。

26S蛋白酶体结构(起源:Wikipedia)
泛素化过程
? 在ATP供给能量的情况下,泛素活化酶E1将泛素分子活化;形成E1-泛素的中央产品;
? 泛素活化酶E1将活化的泛素分子传递给泛素结合酶E2;形成一个E2-泛素的中央产品;
? 泛素衔接酶E3先鉴别待降解的靶蛋白,再将结合E2的泛素衔接到靶蛋白上,形成一个蕴含E2-泛素中央产品、E3 酶和靶蛋白的复合物;
? E2 酶和E3 酶,从上述的复合物中开释,从而形成被泛素象征的靶蛋白;
? 沉复上述过程,直到蛋白质上衔接的多个泛素形成一条泛素链;
? 被泛素化的靶蛋白,被26S 蛋白酶体鉴别和降解。

泛素-蛋白酶体蹊径[2]
泛素活化酶E1抑造剂
哺乳动物中的泛素偶联由两种关键酶启动,即泛素活化酶UAE和UBA6,它们统称为E1酶。UAE(由UBA1基因编码)掌管99%以上的细胞内蛋白泛素化,而UBA6掌管<1%的泛素化。经典的E1酶均拥有腺苷化结构域(AD)、催化半胱氨酸结构域(CCD)以及泛素折叠结构域(UFD)。首先,在ATP和Mg2+存鄙人,E1酶催化Ub与ATP形成Ub-AMP加合物并结合到E1酶的AD结构域,同时开释是磷酸基团PPi,CCD结构域的半胱氨酸巯基亲核进攻Ub-AMP键形成Ub-E1硫酯键并开释AMP,另一个Ub非共价结合到AAD结构域,形成携带两个Ub分子的E1酶。而后,携带两分子Ub的E1酶结合E2酶,通过UFD将Ub转移到E2酶上,形成Ub-E2复合物,接着参加下一个Ub的活化。因而,抑造E1酶活性可能阻断泛素分子的活化,抑造泛素化过程,是潜在的抗肿瘤靶点。
First-in-Class UBA1抑造剂TAK-243
TAK-243(MLN7243)是由Millennium研发的第一个进入临床的UBA1抑造剂,从超过700个化合物中筛选发现的,可能与Ub形成Ub-TAK-243加合物,进而结合到UBA1的ATP结合位点上,抑造UBA1活性。在多种癌细胞中可能诱导泛素介导的p53、c-Jun、c-Myc、XIAP等蛋白堆集并阐发出显著的抗肿瘤活性,目前处于医治晚期恶性实体瘤的一期临床。
TAK-243是一种初创的泛素活化酶 (UAE) 抑造剂。通过形成TAK-243-泛素加合物有效抑造UAE。用TAK-243在体表处置细胞导致细胞泛素偶联物迷失,导致泛素依赖性蛋白质转换和信号传导缺点,细胞周期过程受损和DNA建复缺点,蛋白毒性应激增长,最终导致癌细胞殒命。TAK-243在体内医治肿瘤细胞导致细胞多泛素化急剧削减,并在携带人异种移植肿瘤的幼鼠中诱导显著的抗肿瘤活性。
TAK-243拥有高选择性,抑造UAE, UBA6, NAE和SAE的IC50值别离为 1, 7,28,850 nM。TAK-243-泛素加合物一旦形成,就会与UAE缜密结归并阻断UAE的催化活性。TAK-243抑造UAE将泛素分子转移到E2酶。

A: TAK-243 的化学结构 B: TAK-243-泛素加合物的结构[3]
TAK-243体内抗肿瘤活性钻研
TAK-243的抗肿瘤活性别离通过使用
PDX 和 CDX
肿瘤模型进行钻研验证的。8至 12 周龄幼鼠的侧腹皮下接种肿瘤碎片或无血清造就基中的肿瘤细胞悬液?蒲腥嗽笔褂 CDX 模型在幼鼠中成立了皮下肿瘤:WSU-DLCL2 (弥漫性大B细胞淋巴瘤)、HCT-116(结肠癌)、THP-1(急性髓性白血。WR22(前列腺癌)、Calu-6 (非幼细胞肺腺癌)、HCC-70(三阴性乳腺癌)和 MM1.S(多发性骨髓瘤),以及PDX 模型:PHTX-24c(结肠癌)、PHTX -132Lu(原发性NSCLC)、PHTX-55B(三阴性乳腺癌)、PHTX-235O(卵巢癌)和 HNM626(宫颈癌)。
在此项钻研中,科研人员通过JDB电子使用HCC-70模型进行尝试。在每只雌性裸鼠的腹部移植5.0×106 个HCC-70细胞形成HCC-70模型。当均匀肿瘤体积达到约 200 mm3时,将动物随机分组,每组 8只动物。在随后的21天功夫内按每周两次给药TAK-243(12.5mg/kg) 和对照组 (20% HPβCD)。每周监测两次肿瘤成长和动物体沉。最后一次给药后5天内推算TGI。

TAK-243对HCC-70的成长抑造曲线[3]
钻研发现 TAK-243 在所有查抄的模型中都诱导了显著的抗肿瘤活性反映。其中对CWR22、PHTX-235O、HCC-70和PHTX-55B的TGI达到90%以上。同时对动物体沉险些没有影响。

TAK-243体内抗分歧肿瘤的活性[3]
总结与瞻望
泛素在调节细胞蛋白质稳态和信号传导中的分歧作用凸起了靶向 UPS 调节人类疾病的可能性。只管有这种潜力,但在 UPS 中涉及的 500多种酶中,只有一幼部门是已进入临床钻研药物可靶向的。蛋白酶体抑造剂Bortezomib的临床成功引起了人们对 UPS 的其他成分进行钻研的兴致和周到。TAK-243是一种初创的、高效的UAE抑造剂,可齐全抑造细胞泛素化,导致泛素依赖性蛋白水解受损、ER 应激以及细胞周期过程和 DNA 危险建复受损。体内表数据批注 TAK-243 通过UAE抑造阐扬其作用。TAK-243的发现为钻研蛋白质泛素化提供了一个有价值的工具,并为钻研蛋白质稳态和泛素信号传导以用于肿瘤钻研提供了新的机遇。泛素-蛋白酶体系统是多种疾病出格是肿瘤的沉要靶点,靶向该系统会获得更高的选择性。
参考文件
[1] Marie W Wooten, et al. Signaling, polyubiquitination, trafficking, and inclusions: sequestosome 1/p62's role in neurodegenerative disease. J Biomed Biotechnol. 2006;2006(3):62079.doi: 10.1155/JBB/2006/62079.
[2]Ashok N Hegde, et al. The ubiquitin-proteasome pathway in health and disease of the nervous system. Trends Neurosci. 2007 Nov;30(11):587-95. doi: 10.1016/j.tins.2007.08.005. Epub 2007 Oct 24.
[3]Marc L Hyer, et al. A small-molecule inhibitor of the ubiquitin activating enzyme for cancer treatment. Nat Med. 2018 Feb;24(2):186-193. doi: 10.1038/nm.4474. Epub 2018 Jan 15.
[4] Isabella A Lambert-Smith, et al. The pivotal role of ubiquitin-activating enzyme E1 (UBA1) in neuronal health and neurodegeneration. Int J Biochem Cell Biol . 2020 Jun;123:105746. doi: 10.1016/j.biocel.2020.105746. Epub 2020 Apr 18.
[5] H. Yang, X. Chen, K. Li, et al. Repurposing old drugs as new inhibitors of the ubiquitin-proteasome pathway for cancer treatment. Seminars in Cancer Biology. 2021, 68:105-122.
[6] L. Cappadocia, C. D. Lima. Ubiquitin-like Protein Conjugation: Structures, Chemistry, and Mechanism. Chem Rev. 2018, 118(3): 889–918.
[7] J. A. Harrigan, X. Jacq, N. M. Martin, et al. Deubiquitylating enzymes and drug discovery: emerging opportunities. Nat Rev Drug Discov. 2018, 17(1): 57–78.
JDB电子药理药效服务
新药研发的突破创新,离不开各类科技平台的壮大支持。近年来,药理药效评价、动物模型和基因&细胞疗法等技术不休迭代更新,飞速发展,动物模型已在新药研发过程中阐扬着沉要作用。分歧
疾病动物模型的成立为钻研疾病产生与发展机造、筛选和评价抗疾病药物提供了有力的工具。JDB电子占有约30000平方米尝试室,通过AAALAC认证,加上充足的动物供给,能够执行幼鼠、大鼠、兔、猪、狗、猴等动物的动物模型构建。
JDB电子药理药效部紧跟行业发展与市场需要,不休美满创新,经过多年的经验累积,多方验证和持久实际考验,成立了美满的动物模型库,可凭据客户的需要提供各类有效的动物模型,用来检测药物的有效性。尝试动物有非人灵长类动物、犬、大幼鼠、兔、豚鼠、幼型猪等种类。
? 已成立将近300种肿瘤评价模型,同时我们为创新疗法赋能,全面布局肿瘤免疫疗法的评价和钻研,已实现CAR-T,TCR-T, CAR-NK, 溶瘤病毒, 抗体(单抗,双抗,多抗等),siRNA, AAV等免疫疗法的模型成立及药效评价。
? 凭据客户的需要提供各类有效的动物模型(肾衰模型、血虚动物模型、胃酸排泄动物模型、胃溃疡模型等),用来检测药物的有效性。通例的消化系统疾病有:胃酸排泄、胃溃疡、肾衰等,通过大鼠进行动物尝试。
? 在代谢性疾病领域具罕见十个不变有效的动物模型,尤其对于临床不足有效药物医治、且近期研发火热的NAFLD疾病领域拥有丰硕的经验和有效的动物模型。
? 为炎症免疫疾病药物的药效评价提供了多种针对分歧靶点及通路,不变靠得住,占有优良评价能力的动物药效评价模型,为新药的临床转化提供助力。
? 成立了涵盖抗抑郁药、抗老年痴呆症药、镇静催眠抗焦虑药、镇痛药、抗惊厥药、抗帕金森氏症药以及抗心灵割裂症药等多多疾病心灵系统疾病模型评价技术,能够闯辗视水平、细胞水平、Ex-vivo、invivo等多层面全面评价一类创新药物。
? 凭据客户的需要提供各类有效的动物模型,通例的动物模型有:全层皮肤创伤疾病动物模型、压疮溃疡疾病动物模型、自觉性高血压大鼠疾病动物模型等,通过大幼鼠、SHR大鼠等进行动物尝试。